Sekretariat Jenderal

• Balai Diklat PU Wilayah I (Medan)
• Balai Diklat PU Wilayah II (Bandung)
• Balai Diklat PU Wilayah III (Yogyakarta)
• Balai Diklat PU Wilayah IV (Surabaya)
• Balai Diklat PU Wilayah V (Makasar)
• Balai Diklat PU Wilayah VI (Jakarta)
• Balai Diklat PU Wilayah VII (Palembang)
• Balai Diklat PU Wilayah VIII (Banjarmasin)
• Balai Diklat PU Wilayah IX (Jayapura)
• Balai Pelatihan Air Bersih Dan Penyehatan Lingkungan Pemukiman (Bekasi)

Direktorat Jenderal Sumber Daya Air

• Balai Besar Wilayah Sungai (BBWS)
  • Balai Besar Wilayah Sungai Brantas
  • Balai Besar Wilayah Sungai Bengawan Solo
  • Balai Besar Wilayah Sungai Pemali-Juana
  • Balai Besar Wilayah Sungai Serayu-Opak
  • Balai Besar Wilayah Sungai Cimanuk-Cisanggarung
  • Balai Besar Wilayah Sungai Mesuji-Sekampung
  • Balai Besar Wilayah Sungai Citarum
  • Balai Besar Wilayah Sungai Pompengan-Jeneberang
  • Balai Besar Wilayah Sungai Citanduy
  • Balai Besar Wilayah Sungai Cidanau-Ciujung-Cidurian
  • Balai Besar Wilayah Sungai Ciliwung-Cisadane
  • Balai Besar Wilayah Sungai Sumatera VIII

• Balai Wilayah Sungai (BWS)

  Balai Wilayah Sungai Sumatera I Balai Wilayah Sungai Sumatera II Balai Wilayah Sungai Sumatera III Balai Wilayah Sungai Sumatera IV Balai Wilayah Sungai Sumatera V Balai Wilayah Sungai Sumatera VI Balai Wilayah Sungai Sumatera VII Balai Wilayah Sungai Bali - Penida Balai Wilayah Sungai Nusa Tenggara I Balai Wilayah Sungai Nusa Tenggara II

  Balai Wilayah Sungai Kalimantan I Balai Wilayah Sungai Kalimantan II Balai Wilayah Sungai Kalimantan III Balai Wilayah Sungai Sulawesi I Balai Wilayah Sungai Sulawesi II Balai Wilayah Sungai Sulawesi III Balai Wilayah Sungai Sulawesi IV Balai Wilayah Sungai Maluku Balai Wilayah Sungai Papua

• Balai Bendungan

Direktorat Jenderal Bina Marga

• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional I (NAD,Sumut, Riau dan Kepri) Di Medan
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional II (Sumbar, Bengkulu dan Lampung) Di Padang
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional III (Jambi, Sumsel, dan Babel) Di Palembang
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional IV (Banten, DKI, dan Jabar) Di DKI Jakarta
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional V (Jateng, Diy, Jatim) Di Surabaya
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional VI (Sulsel, Sulbar, Sultra, Sulteng, Sulut & Gorontalo) Di Makasar
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional VII (Kalbar, Kalteng, Kalsel dan Kaltim) Di Banjarmasin
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional VIII (Bali,NTB,NTT) Di Denpasar
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional IX (Maluku & Maluku Utara) Di Ambon
• Balai Besar Pelaksanaan Jalan Nasional X (Papua dan Irjabar) Di Jayapura

Badan Pembinaan Konstruksi dan Sumber Daya Manusia (BPKSDM)

• Balai Peningkatan Keahlian Teknik Konstruksi Jalan dan Jembatan, Bandung
• Balai Peningkatan Keahlian Teknik Konstruksi Sumber Daya Air, Bandung
• Balai Peningkatan Keahlian Teknik Konstruksi Kecipta Karyaan-an, Surabaya
• Balai Peningkatan Keahlian Pengembangan Wilayah dan Teknik Konstruksi, Semarang
• Balai Peningkatan Keahlian Teknik Konstruksi ke-PU-an, Jayapura
• Balai Pelatihan Peralatan, Jakarta
• Balai Pelatihan Jasa Konstruksi, Jakarta
• Balai Pelatihan Konstruksi, Jakarta
• Balai Pelatihan Konstruksi, DI. Yogyakarta
• Balai Pelatihan Konstruksi, Jayapura
• Balai Kajian Penyelenggaraan Konstruksi,Jakarta